Bộ môn khoa học môi trường có ba phòng thực hành trực thuộc hai tổ chuyên ngành là

a. Tổ chuyên ngành chất lượng môi trường: quản lý phòng thực hành chất lượng môi trường và độc học môi trường

b. Tổ chuyên ngành sinh thái môi trường: quản lý phòng thực hành tài nguyên sinh vật 

• Phòng thực hành Chất lượng môi trường
  - Các dụng cụ và thiết bị phân tích chất lượng nước
• Phòng thực hành Độc học môi trường
  -  Các dụng cụ và thiết bị phân tích chất lượng nước, đất và độc tố học thông quá hoạt tính của enzym Acetylcholinteraza
• Phòng thực hành Tài nguyên sinh vật
  -  Thiết bị và dụng cụ thu mẫu sinh vật ở hiện trường như thủy sinh vật, thực vật bậc cao
  -  Kính hiển vi điện tử